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最近做原核表達的幾點(diǎn)教訓和體會(huì )

     最近在做原核表達,包涵體。以前也做過(guò),但經(jīng)驗不多。有那么一點(diǎn)失敗的教訓以及純化過(guò)程中的體會(huì ),現在寫(xiě)出來(lái)與大家共享,同時(shí)希望得到同行們的指正。


     1. 首先介紹一下背景。載體是pET22b,Amp抗性。菌株是BL21 star DE3,是一個(gè)蛋白降解酶突變菌株,也就是說(shuō)是一種優(yōu)化表達菌株。


     2.第一次失敗。第一次做誘導的時(shí)候,重復了很多次,但總是誘導不出來(lái)。PCR,酶切都正確。但沒(méi)等測序結果出來(lái)就開(kāi)始做了,失敗了。曾在網(wǎng)上求助。后來(lái)證明是引物錯誤。我們實(shí)驗室合成引物都要先發(fā)給一個(gè)機構,然后才由他們與公司交涉。這個(gè)office的老太太把引物弄掉了一個(gè)堿基。


     教訓: 在實(shí)驗過(guò)程中,再仔細都是不為過(guò)的。引物來(lái)了后管壁上貼有序列,但我忽略了。


     3. 第二次失敗。后來(lái)重新構建,轉化,誘導。第一次誘導時(shí)根本就沒(méi)帶。然后開(kāi)始找悶頭原因。周一下午5點(diǎn)我就接了DE3菌,由于那天人非常不舒服,去看醫生了,等了很久,到第二天中午11點(diǎn)才轉接!而且是按1:50轉接的!也就是菌在轉接之前培養了18小時(shí)!


     我們都知道,帶Amp的E.coli在含Amp的平板上培養超過(guò)16 小時(shí)后,菌周?chē)鷷?huì )長(cháng)出小菌落,我們叫它衛星菌落。這是因為細菌在生長(cháng)的時(shí)候,為了抵抗Amp,會(huì )分泌B-內酰胺酶,而該酶會(huì )降解培養基中的Amp。對Amp產(chǎn)生抗性的機制和其他抗生素的情況是不同的(具體可以翻看分子克?。?。到菌體生長(cháng)到足夠濃度的時(shí)候,培養基的Amp就會(huì )慢慢減少。 一旦細菌失去選擇壓力,就可能造成質(zhì)粒丟失。當Amp降到很低,不足以抑制細菌生長(cháng)時(shí),未攜帶質(zhì)粒的菌就會(huì )長(cháng)得比帶質(zhì)粒的快。所以當培養時(shí)間足夠長(cháng)后,培養基中的B-內酰胺酶就會(huì )積累到很高的濃度。轉接時(shí)(我是1:50轉的),高濃度的酶可能破壞新鮮培養基中的Amp(而且我用的濃度是50 ug/ml)。這樣,就造成最后收集的菌中,大部分都是沒(méi)有帶質(zhì)粒的菌了。


     當然還有一個(gè)可能的原因就是死亡的菌體分泌一些降解酶,使得表達檢測失敗。


     這兩種推測都只是推測,但我覺(jué)得第一種情況應該引起我們的重視。在使用Amp抗性的時(shí)候要格外注意。

 

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