土壤，是由一層層厚度各異的礦物質(zhì)成分所組成大自然主體。土壤和母質(zhì)層的區別表現在于形態(tài)、物理特性、化學(xué)特性以及礦物學(xué)特性等方面。由于地殼、水蒸氣、大氣和生物圈的相互作用，土層有別于母質(zhì)層。它是礦物和有機物的混合組成部分，存在著(zhù)固體，氣體和液體狀態(tài)。疏松的土壤微粒組合起來(lái)，形成充滿(mǎn)間隙的土壤的形式。這些孔隙中含有溶解溶液（液體）和空氣（氣體），因此，土壤通常被視為有多種狀態(tài) 。
 
      提取土壤中微生物、動(dòng)植物遺體等的DNA是在分子水平上研究生態(tài)、環(huán)境保護與修復及菌種篩選等的基礎。土壤的成分包括礦物質(zhì)、粘土等無(wú)機物、植物及植物的遺體、腐殖物質(zhì)等土壤有機物以及在土壤中存在的微生物，其中絕大部分的微生物都是無(wú)法直接培養進(jìn)行繁殖和研究，從土壤樣品中提取DNA是研究土壤微生物最為有效的方法。
 
      在整個(gè)提取的過(guò)程中，腐殖質(zhì)是最大的干擾因素。腐殖質(zhì)是已死的生物體在土壤中經(jīng)微生物分解而形成的有機物質(zhì)，含有植物生長(cháng)發(fā)育所需要的一些元素，能改善土壤，增加肥力。主要方法是幫助增加可以讓空氣和水進(jìn)入的空隙，也同樣產(chǎn)生植物必須的氮，硫，鉀和磷。動(dòng)植物殘體在微生物作用下形成簡(jiǎn)單化合物的同時(shí)又重新合成復雜的高分子化合物。但是由于腐殖物質(zhì)的性質(zhì)與DNA十分相似，從土壤中提取的DNA的同時(shí)也會(huì )將將腐殖質(zhì)等物質(zhì)一起純化，因而采用一般的DNA提取方法很難除去腐殖物質(zhì)等抑制因子，再加上這些腐殖物質(zhì)會(huì )抑制聚合酶鏈式反應（PCR）及限制性酶切等，因此，徹底去除腐殖物質(zhì)等抑制因子是整個(gè)操作過(guò)程中的重點(diǎn)，也是難點(diǎn)。
 
      目前從土壤樣品中提取微生物DNA的方法主要有直接法和間接法。直接法是指將土壤樣品放在裂解液中，經(jīng)過(guò)有效的破壁方法使微生物的DNA全部釋放到裂解液中，然后再進(jìn)行分離提取的方法。間接法是指將土壤放在一種的緩沖液中，如Buffer PBS等，把微生物從土壤中分離出來(lái)，然后再進(jìn)行DNA的提取。間接法可大大降低土壤中腐殖酸，重金屬鹽對DNA提取帶來(lái)的影響，但是這種方法會(huì )丟失許多微生物，得到的DNA并非土壤樣品中的全基因組(宏基因組)，間接法使用的已經(jīng)很少了。
 
      目前市面上對于去除腐殖質(zhì)工藝做的最好的試劑盒，就是MPbio公司的土壤DNA提取試劑盒，該試劑盒能夠有效去除土壤樣本中的腐殖質(zhì)，極大提高目標DNA的提取濃度，很多土壤相關(guān)工作人員都選用該試劑盒。不過(guò)優(yōu)秀的產(chǎn)品也會(huì )有短板，MP試劑盒在有效去除腐殖質(zhì)的過(guò)程中難免會(huì )造成目標DNA的損失，操作過(guò)程略顯繁瑣，同時(shí)作為一個(gè)進(jìn)口的產(chǎn)品，價(jià)格因素可以說(shuō)是該產(chǎn)品最大的短板。   

      杭州新景生物試劑開(kāi)發(fā)有限公司作為新手福音，業(yè)界良心，經(jīng)過(guò)一系列的研究，終于開(kāi)發(fā)了一種高效的去腐殖酸緩沖液，最大限度的去除土壤樣本中的腐殖質(zhì)，保留目標DNA，結合硅膠柱純化的技術(shù)，得到高純度的土壤微生物DNA。
   

 我們的操作方法和一般的提取土壤DNA試劑盒有所不同，先要進(jìn)行樣本的前處理，將土壤樣本經(jīng)過(guò)去腐緩沖液洗滌，然后進(jìn)行DNA提取得到高純度且不含腐殖酸的土壤DNA。我們可以將多達500 mg的土壤樣本放入含有陶瓷顆粒的2.0 ml試管中，首先使用去腐緩沖液洗滌，離心去上清后使用高效裂解液裂解所有土壤生物，包括之前難以裂解的種類(lèi)，如真細菌孢子和芽孢、革蘭氏陽(yáng)性菌、酵母、藻類(lèi)、線(xiàn)蟲(chóng)和真菌。離心后取上清與結合液結合，過(guò)硅膠柱進(jìn)行DNA純化即可得到高純度DNA。
 
     實(shí)驗室將MP的試劑盒和公司的試劑盒做了一個(gè)平行實(shí)驗，驗證了新產(chǎn)品的結果。