在體外將兩個(gè)或多個(gè)來(lái)源相同或不相同的DNA片段連接成新的重組DNA分子,再轉到特定宿主細胞中進(jìn)行自主復制并表達。這是分子生物學(xué)中的基本技術(shù)。
DNA重組技術(shù)的基本程序包括:
(1)獲得外源DNA:外源DNA是進(jìn)行DNA重組的目的DNA片段,一般采用DNA聚合酶鏈式反應(PCR)或逆轉錄-DNA聚合酶鏈式反應(RT-PCR)、基因組文庫或cDNA文庫篩選等方法獲得。
(2)載體的構建或選擇:分子生物學(xué)中用的載體是指能在特定宿主細胞中自主復制的DNA分子,例如細菌的質(zhì)粒、噬菌體、病毒等,常用的載體一般為質(zhì)粒;根據需要可直接從公司購買(mǎi)合適的載體,也可以自己構建。
(3)連接:目的DNA片段和適當載體的連接,一般采用核酸內切酶分別消化DNA片段和載體,使它們的末端能夠連接到一起構成重組DNA分子。由于所用內切酶的切割特點(diǎn)不同,產(chǎn)生三種連接方式:粘端連接、平端連接和不相配的連接。
(4)轉化:將連接的重組DNA產(chǎn)物導入合適的宿主細胞,使其在宿主細胞內復制擴增或表達,賦予宿主細胞新的生物特征。
(5)克隆化:重組DNA分子轉化大腸桿菌后,在平板培養基上篩選出單個(gè)菌落,此菌落經(jīng)過(guò)酶切鑒定或雜交實(shí)驗后確定為含重組DNA分子的單克隆。
下面以質(zhì)粒為例圖示DNA體外重組的基本程序:
一、基因組DNA的制備
【實(shí)驗目的】
1. 理解生物細胞基因組DNA制備方法的原理。
2. 熟悉組織細胞基因組DNA制備的基本操作。
【實(shí)驗原理】
在陰離子去污劑(SDS-十二烷基硫酸鈉)以及酚/氯仿/異戊醇作用下可以使細胞膜破壞,核蛋白質(zhì)變性,將染色體DNA分離出來(lái)。
【實(shí)驗對象】
新鮮哺乳動(dòng)物組織或細胞。
(一)從哺乳動(dòng)物組織中提取基因組DNA
【實(shí)驗試劑與器材】
1. 消化緩沖液:100mM NaCl,10mM Tris.Cl (pH8.0) 25mM EDTA (pH8.0),0.5% (w/v) SDS,0.1mg/ml蛋白酶K。
2. 7.5mol/L乙酸銨。
3. 100%乙醇。
4. 酚/氯仿/異戊醇。
【實(shí)驗方法與步驟】
1. 將新鮮組織剪成小塊并立即置于液氮中凍存;
2. 將200mg~1g的組織用預冷的研缽研碎,或用錘子將其搗為細粉末,每100mg組織用1.2ml消化緩沖液懸浮,然后于50℃搖蕩溫育12~18h;
3. 用等體積酚/氯仿/異戊醇抽提樣品,1700×g,離心10min。如果樣品溶解得不好,再加1體積不含蛋白酶K的消化緩沖液,重復離心。如果在界面上有一層厚的白色物質(zhì),重復抽提一次,將上層(水溶液)轉移至一個(gè)新離心管中;
4. 加入1/2體積7.5mol/L乙酸銨和2倍體積100%乙醇,12 000rpm離心2min;
5. 用70%乙醇洗滌,晾干,沉淀用TE緩沖液或無(wú)菌雙蒸水重新溶解,使終濃度在約1mg/ml。注: 加入0.1%的SDS和1?滋g/ml無(wú)DNA酶的RNA酶,37℃溫育1h,以除去殘留的RNA。
6. 重復步驟4、5。1g細胞大約能提取到2mg DNA。
(二)從植物組織中提取基因組DNA
【實(shí)驗試劑與器材】
1. CTAB抽提液:2% (w/v) CTAB (十六烷基三甲基溴化銨),100mM Tris.Cl,pH8.0, 20mM EDTA,pH8.0,1.4M NaCl
2. CTAB/NaCl溶液:10% CTAB,0.7M NaCl 配制方法:在80ml雙蒸水中溶解4.1g NaCl,然后緩慢加入10g CTAB (十六烷基三甲基溴化銨),同時(shí)加熱并攪拌,可加熱至65℃溶解,定容終體積至100ml。
3. CTAB沉淀液: 1% (w/v) CTAB,50mM Tris.Cl (pH8.0),10mM EDTA(pH8.0)
4. 高鹽TE緩沖液: 10mM Tris.Cl (pH8.0),0.1mM EDTA (pH8.0),1M NaCl
【實(shí)驗方法與步驟】
1. 在所需量的CTAB抽提液中加入2-巰基乙醇,使終濃度達2% (v/v)。將此溶液及 CTAB/NaCl溶液加熱至65℃。對于每克新鮮的葉組織大約需要4ml的2-巰基乙醇/CTAB抽提液和0.4~0.5ml的CTAB/NaCl溶液;
2. 用液氮(-196℃)或干冰(-78℃)冷凍勻漿器,將植物組織粉碎成為細粉,然后將冷凍的組織轉移到一個(gè)含有機溶劑的試管或燒瓶中;
3. 往粉碎的組織中加入預熱的2-ME/CTAB,混合使之充分濕潤,于65℃溫育10~60min,期間不時(shí)混勻;
4. 用等體積的24:1氯仿/異戊醇抽提勻漿液,上下顛倒充分混合,7500×g,4℃,離心5min,回收上層水相;
5. 加入1/10倍體積的65℃預熱CTAB/NaCl溶液,上下顛倒混勻;
6. 用等體積的氯仿/異戊醇抽提,混勻,離心,回收上層水相;
7. 加入1倍體積的CTAB沉淀液,上下顛倒混勻,如果沉淀可見(jiàn),繼續做步驟8,也可于65℃溫育30min;
8. 500×g,4℃,(或約2700rpm)離心5min;
9. 移出上清,用高鹽TE緩沖液重懸沉淀(按每克起始材料加0.5~1ml),如果沉淀很難溶解,于65℃溫育直至所有的或大部分沉淀溶解;
10. 加入0.6倍體積異丙醇沉淀核酸,充分混勻,7500×g,4℃,離心15min;
11. 用75%乙醇洗滌沉淀物,干燥,用盡可能少的TE或水重懸(每克起始材料0.1~0.5ml)。
【注意事項】
基因組DNA分子量大,所有操作必須輕柔,酚/氯仿對皮膚有腐蝕作用,應該戴手套操作。