Western Blot 即免疫印跡試驗,可以利用 Western Blot 來(lái)比較在不同條件下,不同細胞組織中目的蛋白表達量的差異,屬于定性,半定量試驗。既然有差異性比較,參照物必不可少。Western Blot 試驗中的標準(表達量)參照物即內參,有了參照物才能準確地比較目的蛋白表達量的差異。內參一般選用管家基因表達的蛋白,它們在各個(gè)組織細胞中表達相對恒定,不會(huì )因為外部條件變化而引起表達量的變化。而且內參可以監測整個(gè)試驗體系是否正常,比如蛋白提取過(guò)程,轉膜體系,顯色體系等。
beta Actin、beta Tubulin、GAPDH、Lamin B1、PCNA 等已作為成熟的內參運用到試驗中,下面就大致介紹下如何選擇內參:
樣本來(lái)源
● 如果是哺乳動(dòng)物的組織或細胞,主要以 beta Actin、beta Tubulin、GAPDH、Lamin B1、PCNA 為代表;
● 如果是植物樣本,主要以 actin、Rubisco 為代表。
目的蛋白定位
● 全細胞蛋白和細胞質(zhì):beta Actin、beta Tubulin、GAPDH 等;
● 細胞核蛋白: PCNA 等;
● 核膜蛋白:Lamin B1 等;
● 胞膜蛋白:Na(+)/K(+) ATPase 等。
目的蛋白分子量
beta Actin、beta Tubulin、GAPDH 的分子量分別是 42kd,50kd,37kd,目的蛋白分子量最好能與內參蛋白分子量相差 5kd 以上,才能分開(kāi)目的蛋白和內參,寫(xiě)文章做圖也更美觀(guān);
三大內參
beta Actin,肌動(dòng)蛋白,細胞骨架蛋白。它們在各組織和細胞中的表達相對恒定,在檢測蛋白的表達水平變化時(shí)常用它來(lái)做參照物。beta Actin 作為內參是得到公認的,針對大多數組織和細胞來(lái)說(shuō)的,它廣泛分布于細胞質(zhì)內,表達量非常豐富。但是在一些少量特殊的情況下比如脂肪組織和細胞內,beta Actin 的表達量就很少。
GAPDH,甘油醛-3-磷酸脫氫酶,該酶是糖酵解反應中的一個(gè)酶,幾乎在所有組織細胞中都高水平表達,在同種細胞或組織中的表達量一般是恒定的,且很少受外部誘導物的影響。但比如缺氧和糖尿病等疾病存在下,會(huì )增加
GAPDH 在特定細胞和組織中的表達。
beta Tubulin,微管蛋白,細胞骨架蛋白。作為內參抗體,beta Tubulin 表達通常不會(huì )發(fā)生改變,因此被廣泛用于 Western Blot 內參,也常被用于免疫染色觀(guān)察細胞的微管結構。
(本文轉載丁香園)