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蛋白質(zhì)檢測(體外SUMO修飾實(shí)驗)

小泛素相關(guān)修飾(SUMO)是生物內極為重要的一種蛋白翻譯后修飾方式,是一類(lèi)廣泛存在于真核生物中且高度保守的蛋白質(zhì)家族,它在調節蛋白質(zhì)間相互作用、定位、轉運、轉錄、細胞周期以及拮抗泛素化等方面均發(fā)揮著(zhù)重要的作用。

SUMO修飾是指SUMO共價(jià)結合于靶蛋白的賴(lài)氨酸殘基上,類(lèi)似于泛素化但又不同于泛素化。SUMO通常是非活性的前體形式存在,在酶作用下水解幾個(gè)氨基酸暴露出C端雙甘氨酸殘基,成為具有活性的SUMO分子。當ATP存在時(shí),經(jīng)SUMO活化酶E1、SUMO結合酶E2、SUMO連接酶E3的連續作用,最終與靶蛋白底物耦聯(lián)形成異肽鍵,完成底物的SUMO修飾。

SUMO背景介紹:

SUMO化修飾與一些重要疾病相關(guān)聯(lián)。SUMO 化能影響淀粉樣前體蛋白產(chǎn)生淀粉樣β肽(A β),其機制尚不清楚。過(guò)表達SUMO23,誘導SUMO化 蛋白增加可抑制?β的產(chǎn)生,過(guò)表達SUMO232K11R (其參與形成多SUMO鏈的賴(lài)氨酸殘基敲除)則可 產(chǎn)生相反的效應,說(shuō)明單SUMO化可增強?β的形成,而多SUMO化則抑制?β的形成。多聚谷氨酸(polyQ)重復擴增可引起何杰金氏病(HD)、脊髓小腦共濟失調、Machado2Joseph病和 延髓脊髓性肌萎縮等神經(jīng)退行性疾病。研究顯示,患這些疾病的患者受損腦區神經(jīng)元SUMO21染色增強,說(shuō)明SUMO化修飾也參與調節polyQ的重復擴增。應用HD果蠅模型證明Huntingtin(Htt)polyQ區的一個(gè)片段,既可被SUMO,又可被泛素化。泛素化可消除神經(jīng)退行性變,然而SUMO化則可加劇神經(jīng)退行性變。SUMO化的Htt穩定,不易聚集,具有較強的抑制轉錄能力。SUMO化促進(jìn)可溶性毒性Htt寡聚體的聚集,通過(guò)抑制轉錄而 介導神經(jīng)退行性變。


1、感受態(tài)細胞的制備

(1)準備LB培養基:0.5%酵母浸提物、1%胰蛋白胨、1%NaCl(PH 7.0),高壓滅菌,4℃保存備用。

(2)準備LB瓊脂平板:取新鮮配置的100-200mlLB培養基,加入1.5g瓊脂糖,高壓滅菌,冷卻至60℃,液體倒入已消毒的平皿中,凝固后4℃保存備用。

(3)無(wú)菌條件下,用接種環(huán)蘸取少量大腸埃希菌DH5aIM109菌液,在不含抗生素的LB瓊脂糖平板上劃線(xiàn),37℃過(guò)夜培養。

(4)LB平板上挑取一個(gè)單菌落,放入含2mlLB培養基的試管中,37℃恒溫搖床220rpm振蕩培養過(guò)夜。

(5)500ul菌液,轉入含50mlLB培養基的培養瓶中,37℃恒溫搖床180rpm振蕩培養至OD600=0.8-1.0。

(6)7000g,4℃,離心5min收集細胞。

(7)25ml預冷50mmol/L CaCl2 溶液重懸細胞,冰浴30min。

(8)6000g,4℃,離心5min收集細胞。

(9)4ml預冷100mmol/L CaCl2 溶液重懸細胞。

(10)加入1ml甘油混勻,100ul/凍存管分裝,-80℃保存備用。

2.SUMO基因重組質(zhì)粒的轉化及擴增

(1)10ngSUMO基因重組質(zhì)粒,加入50ulDHαJM109感受態(tài)細胞。

(2)冰浴30min 到42℃水浴,熱休克60-90s 到冰浴5min。

(3)在試管中加入950ul不含抗生素的LB培養基,37℃恒溫搖床220rpm振蕩孵育40-60min。

(4)44000g,離心2min收集細胞。

(5)20ul菌液放入含抗生素LB瓊脂糖平板,將細菌均勻涂至整個(gè)平板表面。

(6)37℃恒溫培養箱中培養16-24h。

(7)試管中加入2-5ml含抗生素的LB培養基,挑取單克隆菌落放入試管。

(8)37℃恒溫振蕩培養過(guò)夜。

2.SUMO質(zhì)粒DNA的提取

(1)1.5ml離心管取少量菌液,離心后棄掉上清液。

(2)250ul P1溶液重懸菌株,漩渦振蕩使菌液重新完全懸浮。

(3)加入250ulP2溶液,輕輕渦旋4-6次混勻。

(4)加入350ulN3溶液,輕輕渦旋4-6次混勻。

(5)13000rpm(或17900×g)離心10min。

(6)用移液槍輕輕吸出上清放入QIAprep spin柱中,放置1-2min。

(7)13000rpm離心30-60s,棄濾液。

(8)500ul PB緩沖液,13000rpm 離心30-60s,棄掉濾液。

(9)加入750ulPE緩沖液,13000rpm離心30-60s,棄掉濾液。

(10)13000rpm再次離心1min,甩干殘留液體。

(11)QIAprep spin柱置于一個(gè)新的1.5ml離心管中,加入50ulEB溶液,室溫放置10min。

(12)13000rpm離心1min,管底即為質(zhì)粒DNA。

(13)檢測質(zhì)粒DNA的濃度。

(14)-20℃保存備用。

3.SUMO質(zhì)粒瞬時(shí)轉染

(1) 將生長(cháng)狀態(tài)良好的細胞接種于直徑4-6cm的培養皿中,5% CO2,37℃培養箱內培養16-24h,細胞融合至60%-90%時(shí)可進(jìn)行轉染。

(2) 轉染前1h將細胞培養液換成不含抗生素的培養液。

(3) Opti-EME培養液稀釋4倍的Lipo2000試劑。

(4) Opti-EME培養液稀釋SUMO質(zhì)粒。

(5) 將上兩步溶液按1:1比例混合配成轉染復合液,室溫,孵育20min。

(6) 將已接種細胞的培養皿中加入200ul轉染復合液,充分混勻。

(7) 繼續培養4-6h,更換正常培養液。

(8) 培養24-72h,鏡下觀(guān)察和檢測帶有熒光標記的SUMO質(zhì)粒的表達。

4.帶標簽的SUMO的制備(以His-SUMO為例)

(1)培養細胞、誘導及收獲。

2)每200ml菌液收獲的菌體加入5ml His裂解液,重懸沉淀。

3)冰浴條件下,超聲破碎沉淀。

44℃,10000rpm,離心1h

(5)取上清液,加入Ni-NTA agarose,4℃,混合1-2h。

(6)將混合物裝柱用His洗滌液洗滌,直到檢測不到蛋白濃度。

(7)His洗脫液進(jìn)行洗脫,按洗脫次序每管收集500ul。

(8)考馬斯亮藍染色檢測蛋白。

5.SUMO化蛋白的檢測

(1)培養細胞,待細胞融合至90%左右。

2PBS洗滌細胞2次,0.25%胰酶消化細胞。

31000rpm,離心3-5min收集細胞。

(4)PBS洗滌細胞2次。

(5)1000rpm,離心3-5min,棄掉上清液。

(6)加入50ul細胞裂解液,冰浴10min。

(7)4℃,12000g,離心15min。

(8)取上清液,檢測蛋白濃度。





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