一、限制性?xún)惹忻?對DNA消化的方案
1.限制性?xún)惹忻阜磻跍缇?/span>0.5ml離心管中進(jìn)行。
2. 20μl體積反應體系如下:
DNA 0.2-1 μg
10×酶切buffer 2.0 μl
限制性?xún)惹忻?1-2 u(單位)
加ddH2O 至 20 μl
限制性?xún)惹忻缸詈蠹尤?,輕輕混勻,稍加離心,放置于最適溫度水浴并按所需的時(shí)間溫育,一般為37℃水浴消化3hr。
3.用于回收酶切片段時(shí),反應總體積可達50-200μl,各反應組分需相應增加。
4.多種酶消化時(shí)若緩沖液條件相同,可同時(shí)加入;否則,先做低溫或低鹽的酶消化,再做高溫或高鹽的酶消化。
5.酶切結束時(shí),加入0.5M EDTA (pH 8.0)使終濃度達10mM,以終止反應?;驅⒎磻茉?/span>65℃水浴放置10min以滅活限制性?xún)惹忻富钚浴?nbsp;
6.如消化反應體積過(guò)大,電泳時(shí)加樣孔盛不下,可加以濃縮:終止反應后,加入0.6體積的5M乙酸銨(或1/10體積3M NaAc)和2倍體積無(wú)水乙醇,在冰上放置5min,然后于4℃離心12000g× 5min。傾去含大部分蛋白質(zhì)的上清液。于室溫晾干DNA沉淀后溶于適量TE中(pH 7.6)。
7.如要純化消化后的DNA,可用等體積酚/氯仿(1∶1)和氯仿各抽提一次,再用乙醇沉淀。
二、電泳檢測
取質(zhì)粒酶切產(chǎn)物適量,加適當loading buffer混勻上樣,以未經(jīng)酶切的質(zhì)?;?/span>/和酶切的空載體(如有)作對照,采用 1-5V/cm的電壓,使DNA分子 從負極向正極移動(dòng),至合適位置取出置紫外燈下檢測,攝片。
三、注意事項
1.濃縮的限制性?xún)惹忻缚稍谑褂们耙?/span>1×限制酶緩沖液稀釋?zhuān)形鹩盟♂屢悦饷缸冃浴?nbsp;
2.購買(mǎi)的限制性?xún)惹忻付啾4嬗?/span>50%甘油中,于-20℃是穩定的。進(jìn)行酶切消化時(shí),將除酶以外的所有反應成分加入后即混勻,再從-20℃冰箱中取出酶,立即放置于冰上。每次取酶時(shí)都應更換一個(gè)無(wú)菌吸頭,以免酶被污染。加酶的操作盡可能快,用完后立即將酶放回-20℃冰箱。
3.盡量減少反應體積,但要確保酶體積不超過(guò)反應總體積的10%,否則酶活性將受到甘油的抑制。
4.通常延長(cháng)時(shí)間可使所需的酶量減少,在切割大量DNA時(shí)可用。在消化過(guò)程中可取少量反應液進(jìn)行微量凝膠電泳以檢測消化進(jìn)程。
5.注意星號酶切活力。