獻給初學(xué)者:如何看流式細胞術(shù)結果中的圖?
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發(fā)布時(shí)間:2017-09-27
FCM 數據的存貯的方式是 FCS2.0(flow cytometry standard),采用列表排隊(List Mode)方式。易于加工處理分析,但缺乏直觀(guān)性,數據的顯示通常有一維直方圖、二維點(diǎn)圖、等高線(xiàn)圖、密度圖等幾種。由數據還可以做出標準曲線(xiàn)進(jìn)行定量分析。
坐標軸的意義?
單參數直方圖
每一個(gè)細胞單參數的測量數據可以整理成統計分布,以直方圖的方式來(lái)顯示。在圖中,橫坐標表示熒光信號或散射光信號相對強度的值,其單位是道數(channel),可以是線(xiàn)形(line)或者對數(log)??v坐標一般是相對細胞/粒子數(count)。
二維圖
在二維圖的中,橫坐標/縱坐標都表示熒光信號或散射光信號相對強度的值,可以是線(xiàn)形(line)或者對數(log)。雙參數圖可以將樣品細胞群分開(kāi),從而方便對感興趣的細胞進(jìn)行分析。
「Gate」和 「Regin」?
設門(mén)是流式細胞分析中一種重要的技術(shù),只有通過(guò)最佳的設門(mén)方式,才能準確地獲取和分析數據,從而得到臨床診斷和科研中有價(jià)值的信息。
On-line gating(threshold gating) 監測/獲取數據
Off-line gating: 分析實(shí)驗數據
散射光設門(mén)/熒光設門(mén)
散射光/熒光聯(lián)合設門(mén)
多重邏輯門(mén)(組合門(mén))多重邏輯門(mén) G3=R1 and R2 (G3=R1×R2)
其它: G=R1 or R2 G=R1 not R2
流式圖中的顏色與熒光顏色?
流式圖中的顏色為區分不同細胞群而人為指定,與熒光顏色無(wú)關(guān)。
流式圖中的陰/陽(yáng)(N/P)如何劃分?
如何做 M1 陰性界限?實(shí)際上,這個(gè) M1 的劃分完全是根據陰性 (同型)對照來(lái)的。如下圖:左圖為同型對照,即:您所檢測的物質(zhì)在陰性組中的基礎表達量,可以理解為背景、靜息狀態(tài)下、基礎水平、未受刺激時(shí)等。右圖即陽(yáng)性組,也就是接受刺激后,功能狀態(tài)下、藥物作用后等。
陰性正好在 101 劃分?
其實(shí),我們可以人為地將電壓,放大倍數調到相應的大小,使陰性的右邊界在某一個(gè)值上,(通常劃在 101 附近)這樣后期做 sample 時(shí)好看。當然也可以調到 102,103 次方。
為什么要進(jìn)行熒光補償?
流式細胞分析中經(jīng)常要用到 2 種以上的熒光標記抗體進(jìn)行染色,而目前所使用的多種熒光染料發(fā)射譜間有一定重疊。
「熒光補償」這個(gè)術(shù)語(yǔ)是指修正熒光滲漏的過(guò)程,如從探測器除去除匹配熒光以外的任何熒光信號。
(本文轉載:丁香通)